1. 小麦镰刀菌超标
1、危害小麦储藏的主要害虫有：玉米象、米象、锯谷盗、大谷盗、长角谷盗、谷蠹、印度谷蛾、麦蛾、腐食酪螨等。
2、危害小麦储藏的微生物主要有：除与危害稻谷的储粮微生物相同外，还有交链孢霉、禾镰刀菌(田间危害名为赤霉病)，入仓后如遇湿度大，温度高，能继续发展危害，且可能产生毒素，造成人畜中毒现象发生。
3、老鼠：危害小麦储藏的鼠类主要有褐鼠、黑鼠和小家鼠。 小麦“三低”储藏 ：“三低”储藏一般也是指低氧储藏、低药熏蒸和低温储藏三项储藏技术先后综合用于保管小麦的方法。
2. 小麦细菌病
小麦青枯病是指小麦植株未能正常落黄就枯萎死亡的现象。青枯病发生速度快，持续时间短，减产幅度大，一旦发生便无法挽救。 一、发生原因： 1、气候原因。小麦进入灌浆期后，气温升高很快，气温大于30度的天数明显增多。气温升高的同时，往往出现降雨过程，受降雨影响，容易出现大幅度突然降温现象，雨后骤晴，气温又猛然回升，小麦植株适应不了气温的这种骤然的变化，体内新陈代谢发生紊乱，出现青枯现象。 2、播期原因。播期越晚，越容易受青枯病危害。晚播小麦冬季苗体小，春季生长速度快，两极分化晚，体内含氮化合物比例大，抗逆能力差，极易发生青枯死亡。 3、施肥原因。青枯与肥料配比、肥料使用量及使用时期有很大关系。施氮肥过多，不施或很少施磷钾肥、农家肥的麦田，小麦植株体内含氮化合物就会增多，极易发生青枯病。拔节期施氮肥过多，也是发生青枯的主要原因。 二、预防措施： 1、控制小麦中后期氮肥的使用量。2、叶面喷施生长调节剂、磷酸二氢钾、微肥等。具体方法是，小麦抽穗后，配合病虫害的防治，每亩选用磷钾动力 100克 +海绿素15毫升，间隔7-10天，连续喷施2-3次。
3. 小麦镰刀菌毒素
增效效应(Potentiative effects)是指一种霉菌毒素对某组织或器官不产生毒性作用，但摄入另一霉菌毒素后，前者使后者毒性增强，如萎蔫酸就是一种最常见的镰刀菌毒素Bacon等，l996)，它可增强呕吐毒素的毒性(Smith等，l997)，但在没有其他霉菌毒素存在的情况下萎蔫酸的毒性就非常弱，以致在生产中很少检测饲料中的萎蔫酸含量(Smith等1991；Smith和Sousadias，1993)。
4. 小麦禾谷镰刀菌
【东北玉米的呕吐毒素】呕吐毒素主体成分为DON（deoxynivalenol, 脱氧雪腐镰刀菌烯醇），属于单端孢霉烯族化合物，主要由禾谷镰刀菌、尖孢镰刀菌、串珠镰刀菌、拟枝孢镰刀菌、粉红镰刀菌、雪腐镰刀菌等镰刀菌产生，尤其是禾谷镰刀菌和黄色镰刀菌。另外，头孢菌属、漆班菌属、木霉属等的菌株都可产生该毒素。
由于温度、湿度等的差别，不同地区、同一季节收获的玉米所带菌属有较大差别，同一地区、不同季节、不同年份的玉米所带菌属也不一样。
北方地区的玉米（如河南、山西等地的部分玉米）以镰刀菌为主要菌属，而东北玉米以圆弧青霉为主要菌属，镰刀菌次之。【呕吐毒素】英文名：vomitoxin，又称脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)，化学名为3α, 7α, 15一三羟基草镰孢菌-9-烯-8-酮，属单端孢霉烯族化合物。由于它可以引起猪的呕吐而得名，对人体有一定危害作用，欧盟分类标准为三级致癌物。
5. 小麦玉米限量标准的镰刀菌
生石灰能杀孢子镰刀菌。
镰刀菌主要可以引起根腐病、茎腐病、茎基腐病、花腐病、穗腐病等病害，它是农业生产上比较难防治的病菌之一。镰刀菌的寄主植物有100种左右，它可以侵染寄主植物的维管束系统，并且会破坏植物的输导组织，同时它在生长发育和代谢的过程中会产生毒素，这会使得作物因萎蔫而死亡，从而影响作物的产量以及品质。
镰刀菌根腐病防治方法：
(1)选用无病健康的种子和种苗。
(2)选择排水良好、土壤疏松的地块种。
(3)及时清除病株或病根，病穴用石灰或药剂消毒。
(4)冬春防止忽干忽湿，旱季要及时浇水，雨后及时排水，提倡施用酵素菌沤制的堆肥。