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蛋白质测序仪主要检测(蛋白质测序仪主要检测什么项目)

来源:www.haichao.net  时间:2023-01-20 06:34   点击:291  编辑:admin   手机版

1. 蛋白质测序仪主要检测什么项目

在回答这个问题时我们先来了解下什么叫驱动基因。

驱动基因是指癌症发生发展时的相关存在的重要基因,又称驱动基因。

驱动基因特性及应用:每种驱动基因致病作用是不同的。不同的癌症病人有不一样的驱动基因,当它发生驱动基因突变时,就能把癌细胞“驱动”起来引发所攻击部位器官发生癌变。如80%的不吸烟腺癌的驱动基因为表皮生长因子受体(EGFR)都是受它驱动的。因此找到驱动基因对于开展针对性的治疗有着十分重要的意义。临床上常用靶向药物进行“量体载衣”式的个性化治疗癌症病人。

临床常用的驱动基因检测技术有数十种,这里以三甲医院实验室常用的方法例举介绍如下:

1:免疫组织化学法

2:荧光原位杂交法

3:FISH检测法

4:基因测序法

5:高通量测序法

6:等位基因特异性检测法

7:液体活检检测法

总之上述的这些方法技术原理:都是通过筛查驱动基因突变和癌细胞中能编码关键蛋白的基因演变对细胞生长影响的驱动突变信号。癌基因依赖倾向使驱动基因突变成为很好的生物标志物。如肺癌患者血液中常存在无细胞ctDNA和循环肿瘤细胞。临床中常见的突变驱动基因有:表皮生长因子受体基因,突变或间变性淋巴瘤激酶以及ROSl基因重排等驱动基因。

2. 蛋白质测序仪主要检测什么项目的

外显子组测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。

外显子测序相对于基因组重测序成本较低,对研究已知基因的SNP、Indel等具有较大的优势,但无法研究基因组结构变异如染色体断裂重组等。

外显子(expressed region)是真核生物基因中负责编码蛋白质的DNA序列,是基因最重要的直接功能区域。外显子测序是指利用序列捕获技术将基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。

3. 蛋白质测定法有哪些

对角线电泳是一种经典的二硫键定位分析方法.这种技术包括:(1)胃蛋白酶酶切未经还原的蛋白质;(2)在酸性pH=6.5的条件下进行第一向电泳,酶解产物肽段将按其大小及电荷的不同而分离;(3)将滤纸暴露在过甲酸(CHOOOH)蒸气中,使二硫键氧化断裂,并进一步氧 化成磺酸基,被氧化的半胱氨酸称为磺基 丙氨酸;(4)将滤纸旋转90.角,在与第一向完全相同的条件下进行第二向电泳.无二硫键的肽不受酸的作用而在两向电泳中迁移率相等,将位于一条对角线上.那些含二硫键的肽由于第二向电泳时被酸氧化,肽段大小和负电荷发生变化而使迁移率不同,将偏离对角线.肽斑可通过茚三酮显色来确定.将含磺基丙氨酸的肽段分别取下,进行氨基酸序列分析,推断二硫键的位置.如果蛋白质中存在其他未成二硫键的半胱氨酸,要先用碘乙酰胺封闭其一SH后再酶解.此外甲硫氨酸和色氨酸也能被氧化,这样可能会增加分析的复杂性.

4. 检测蛋白质的仪器叫什么

一般是根据产品标准要求选测定方法的,食品中蛋白质测定的最常用方法当然是凯氮测定法:常量凯氏定氮法和微量凯氏定氮法.我大学时还做过考马斯亮蓝半微量定氮法,与最新标准一致,我这有稍微简化的方法:以饼干为例:称取2.000克于定氮瓶中,加20mL浓硫酸,加0.2g硫酸铜,加3.0g硫酸钾,然后进行消化,消化至澄清液体后倒入100mL具塞比色管,3次清洗定氮瓶,洗液并入100mL具塞比色管,蒸馏水加至100mL刻度线,摇匀,取10mL进半微量定氮装置蒸馏,收集瓶中为2%硼酸溶液10mL,以甲基红-亚甲蓝为指示剂2滴,用购置的0.1000标准溶液进行滴定,步骤结束.要点:称量需准确;吸取也准确;玻璃仪器需检定合格.

5. 蛋白质测序仪的基本工作原理

sanger对蛋白质测序的贡献则是蛋白质N端测序技术,里面涉及到一种关键试剂叫做sanger试剂(2,4-二硝基氟苯)。在弱碱性溶液中,氨基酸的α-氨基很容易与2,4-二硝基氟苯作用,生成稳定的黄色2,4-二硝基苯氨基酸。该反应由F. Sanger首先发现,所以此反应又称桑格反应(Sanger reaction)。一般sanger法用来鉴定蛋白质N端的氨基酸残基。

6. 蛋白质测序仪主要检测什么项目的结果

肿瘤基因检测,是针对引起肿瘤的致病突变进行的检测。根据检测目的主要分为两类:指导肿瘤患者的精准治疗,评估肿瘤患者的亲属罹患肿瘤的易感性。

肿瘤的本质是体细胞突变累积的结果。通过二代测序技术检测患者的肿瘤组织中含有哪些突变,确认引起在肿瘤发生过程中发挥驱动作用的突变,就可以针对性使用靶向药物。靶向药物相比传统化疗药物具有针对性强,副作用小的优点,可有效改善肿瘤患者的预后。靶向药物在肺癌治疗中的应用经验最丰富。目前有条件的肺癌患者需要常规进行基因检测,有助于临床医生选择个体化的医疗方案。

有一些肿瘤的遗传性很强,比如卵巢癌,乳腺癌,结直肠癌等。这意味着肿瘤患者的亲属也有可能发生肿瘤。最著名的例子是安吉丽娜朱莉,她的妈妈和姨妈都患有乳腺癌,提示她的家族可能存在乳腺癌致病基因。为了确认自己是否携带相关致病基因,她进行了BRCA基因检测,发现自己果然携带这个BRCA1基因突变。

携带这种基因突变并不意味着一定发生肿瘤,但是肿瘤发生的风险要远高于一般人。因此她先后切除了乳腺和卵巢,预防乳腺癌和卵巢癌的发生。需要注意的是,进行这种基因检测,使用的是血液样本。

以上只是简单介绍了肿瘤基因检测的两个最主要目的。实际上根据不同的检测技术和检测样本,肿瘤基因检测还可以实现肿瘤早期筛查和诊断,肿瘤动态检测,肿瘤患者预后等多种目的。肿瘤基因检测专业性较强,需要配套相应的遗传咨询,与临床,实验室,患者三方面充分沟通,才能全面发挥肿瘤基因检测的重要作用。

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